צ'רלס דרווין פקד את איי גלפגוס בשנת 1835. על אף שהוא שהה בארכיפלג קצת יותר מחודש ימים, הוא עצמו מעיד כי איי גלפגוס הם מקור ההשראה שהניעה אותו לפתח את תיאורית האבולוציה ולפרסם, יותר מעשרים שנה לאחר שובו ממסעותיו עם רב החובל פיצ'רוי על גבי ואניית הוד מלכותה הביגל, את ספרו רב ההשפעה "מוצא המינים".
שייט בגלפגוס הוא הזדמנות לחוש את מה שתפס כל כך את דרווין, פלאי בריאה המתגלים לנגד עיננו במלוא תפארתם.
כמעט כולם יודעים שקיים קשר הדוק בין המסע שערך צ'רלס דרווין, אבי תורת האבולוציה, באיי הגלפגוס וההשראה שהניעה אותו לכתוב את ספרו המפורסם ביותר "מוצא המינים" (The Origin of Species). טיול לגלפגוס הוא הזדמנות לחוש את אותה התרגשות שאחזה בדרווין למראה מגוון בעלי החיים ולהבין איך קרה שדווקא מאזור קסום זה של כדור הארץ צמחה התיאוריה שבכוחה להסביר את אופן התפתחתם של החיים על פני כוכב הלכת כולו.
חמישה שבועת שהעניקו לדרווין את כל התחמושת למפעל חייו
דרווין היה רק בן 22 כשרב החובל פיצ'רוי נאות לצרפו אל חברי משלחת המחקר שיצאה על גבי ספינת הוד מלכותה H.M.S (Her Majesty's Ship) ביגל (Beagle). הוא למעשה היה האדם האחרון שצורף למשלחת, כונה "חוקר הטבע" (naturalist) ולא זכה לכל תשלום עבור השנים שהקדיש לעבודה המסורה שעשה במהלך המסע שמטרתו הייתה מיפוי חופי דרום אמריקה. הסיבה שרב החובל פיצ'רוי (דמות מרתקת בפני עצמו) צירף את דרווין למשלחת הייתה החלטתו לתת הזדמנות זו ל"מישהו שיוכל להפיק תועלת מן המסע", הישגיו של דרווין מעידים על כך שפיצ'רוי לא יכול היה לבחור מועמד מתאים יותר.
בשנת 1835, במהלך חציית האוקיאנוס השקט בדרכה לשוב לאנגליה, הביגל עגנה בנמלים שונים באיי גלפגוס. קבוצה של איים געשיים כ1000 קילומטרים מערבית לאקוודור היבשתית. אוכלוסיית האיים מונה כיום רק כ25,000 בני אדם כך שבימיו של דרווין הם היו בתוליים ממש.
דרווין זכה לבלות 35 ימים מופלאים באיי גלפגוס, הוא ערך רישומים (כולל שלל ציורים) בניסיון לאחוז במידע רב ככל האפשר אודות הזואולוגיה של האיים. דרווין זיהה מהר מאוד שכאן ישנה הזדמנות להתחקות אחר האופן בו מתפתחים החיים, לא רק היות והוא נתקל באיי גלפגוס בבעלי חיים שונים ומשונים שלא ראה מימיו (כגון צבי הענק המפורסמים ולטאות האיגואנה הימיות) אלא בזכות העובדה שהיו זנים ייחודיים של בעלי חיים באיים השונים, שהמקומיים אפילו ידעו לזהות לאיזה אי שייך צב ים ענק מסוים.
דווקא מין של ציפור שיר קטנה ובלתי מרשימה יחסית, פרושית (Finch), תפסה מקום מרכזי ברישומיו של דרווין. הוא תיעד 13 מינים שונים כאשר לכל אחד מהם תכונות שהפכו אותו למתאים במיוחד לתנאים הייחודיים של האי עליו חי. ציפורים אלה מכונות כיום על שמו - Darwin's Finches.